Der Begriff Mikrobiom fasst die genetische Information aller Mikroorganismen zusammen. Je nach Lebensraum unterscheidet man beispielsweise das Mikrobiom aller im Darm (Mikrobiom der Darmmikrobiota) oder auf der Haut (Mikrobiom der Hautmikrobiota) lebenden Mikroorganismen. Im weiteren Sinne wird der Begriff Mikrobiom oft gleichbedeutend mit dem Begriff Mikrobiota verwendet.

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